Рутокен использует различные криптографические алгоритмы, включая ГОСТ и другие международные стандарты. Это позволяет устройствам Рутокен быть совместимыми с различными системами безопасности и обеспечивать надежную защиту данных.Электронные идентификаторы часто используются в сочетании с соответствующими программно-аппаратными средствами. Рутокен Lite поддерживает основные промышленные стандарты, что позволяет легко интегрировать его в существующие системы информационной безопасности.
Для работы с Рутокен Lite используется драйвер CCID, который входит в состав современных операционных систем. Дополнительное программное обеспечение не требуется, за исключением тех СКЗИ и приложений, которые работают с этим устройством.